故事简介无印篇
在无印篇中，新手训练家小智从大木博士那里获得的是一只勉勉强强又喜怒无常又不喜欢进入神奇宝贝球的皮卡丘，小智离开家乡真新镇，在关都地方展开他的旅程。在赢得皮卡丘的信任后，小智认真地开展他的旅程来挑战各地的道馆，参加神奇宝贝联盟。在旅途中加入小智的是两位良师益友——小刚和小霞。
参加石英大会之后，小智受大木博士之托启程前往橘子群岛，从内木博士处取得GS球，小刚暂时留在内木博士处。旅途中小智参赛橘子联盟，还遇到神奇宝贝观察家小建，便与他一同旅行。回到真新镇后，大木博士无法理解怎么样把GS球打开，所以就把小建留下做助手，派小智、小霞、小刚前往城都地区，把GS球交给桧皮镇的钢铁先生。再次，小智参加了神奇宝贝联盟－城都联盟的白银大会。[1]
超世代城都联盟篇结束后，小霞为了接替出门旅行的三位姐姐而不得不返回华蓝市担任道馆训练家，小刚也因为因家里有事和小智分离了。小智重新出发，基于想要以一个新人的心态继续学习的心态，所以只带着皮卡丘只身前往丰缘地区，在那里认识了新人训练家小遥和其弟弟小胜，后来小刚又重新加入，于是四人并展开全新的冒险。
超世代共分为丰缘联盟及对战开拓区两篇，和第一部的不同之处是，故事变成了两条主线：一方面小智为了参加丰缘联盟，努力挑战道馆而收集徽章。联盟大会结束后，则改挑战故乡关都地区的对战开拓区；另一方面小遥则以成为顶级协调训练家为目标，挑战各地的华丽大赛取得缎带，参加华丽大型庆典。两人都为了达成各自的目标，与神奇宝贝一同奋斗。
钻石与珍珠对战开拓区篇结束后，小遥为了独自挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆。小智则受到了小茂的鼓励，独自带着皮卡丘和偷渡的长尾怪手前往神奥地区开始新的挑战。
小智、小光和小刚3人的旅程并非一帆风顺，他们在路途上遇上很多人和事，小智曾惨败给真司，小光也曾在2次华丽大赛的第一次审查惨遭淘汰出局。几经辛苦，小光终于集齐5枚缎带徽章，她在神奥华丽大型庆典表示出色，首次参加便晋级至决赛，但在决赛以稍微差距败于好友小望；小智亦集齐8枚徽章，他在神奥联盟有好开始，在第1回战打败尚志，第2回战打败某女路人，第3回战(16强)打败考平，8强更打败真司，可是他无法势如破竹而在准决赛惨败于达克多，4强出局。
随着小智取得8个徽章,日本于2012年6月21日播放“ 2”，讲述小智一行人于合众联盟开始前，前往东合众地区参加神奇宝贝世界锦标赛青少年杯为开端的故事。后来小智在合众联盟8强出局，随后于2013年1月17日开始播出第2季的新章节“ N”，重新诠释因311日本大地震而未能如期播出有关的等离子队剧情。
神奇宝贝《神奇宝贝XY》主角，来自卡洛斯地区的米亚雷市，是柠檬的妹妹，是小智在卡洛斯地区旅行的同伴之一，性格坚毅，是一个可靠的小女孩，由于未满十岁，还不是神奇宝贝训练家，她只能“保管”柠檬的神奇宝贝，对于邂逅新的神奇宝贝感到兴奋，尽管她不能拥有神奇宝贝，但她尽自己所能参加各种活动，十分享受照顾神奇宝贝的过程。
主要作品电视动画日本播放的《神奇宝贝》系列动画分为不带小标题的无印篇动画和附带小标题的其他四部动画，后者在设定上基于各自的游戏版本而有所不同，并未按照季度划分。目前正在播放的是《神奇宝贝XY》（ポケットモンスターXY）。
动画电影在主系列动画的放送过程中，描述电视动画系列主角特定冒险经历的神奇宝贝剧场版（剧场版ポケットモンスタ）会上映。截至目前共有17部剧场版和2部特别电视直播短片（第一部“超梦重现风云再起”，常用译名“超梦，我就在这里！”在日本以外的地区采取录像带首映，第二部是“战栗的幻影神奇宝贝”）。每一部剧场版的剧情包括与一只传说中的神奇宝贝的邂逅。剧场版同样被用来宣传将在游戏新作中出现的神奇宝贝。
动画短片皮卡丘短片是一系列以皮卡丘为主角的动画短片的统称。这些短片有作为OVA发售的，也有与电影版一同放映在主片前播放的，或于ANA机上放映，另外还有两部3D电影单独放映，非OVA的基本都是限定期间放映。
主题曲片头曲
神奇宝贝神奇宝贝(1-275)共5首：
•OP1关都(石英)联盟篇-“目标是神奇宝贝大师”（めざせポケモンマスター）
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：渡部チェル
•OP2橘子群岛篇-“劲敌”（ライバル）
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず
•OP3城都联盟篇1-“OK！”
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•OP4城都联盟篇2-“目标是神奇宝贝大师～热情重唱版”（めざせポケモンマスターホワイトベリー）
歌：ホワイトベリー、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：坂井纪雄
•OP5城都联盟篇3-“！”
歌：田村直美、作词：田村直美•川村久仁美、作曲•编曲：たなかひろかず
神奇宝贝新世代(1-191)共5首：
•OP1丰缘（芳缘）联盟篇1-“冒险･前进～～”（アドバンス･アドベンチャー～～）
歌（ガーデン）、作词作曲•编曲：たなかひろかず、ホーン（ブラス）アレンジ：佐野聡
•OP2丰缘（芳缘）联盟篇2-“挑战者！！”（チャレンジャー！！）
歌：松本梨香、作词：许瑛子、作曲•编曲：たなかひろかず
•OP3丰缘（芳缘）联盟篇3-“神奇宝贝交响组曲”（）
•OP4对战开拓区篇1-“对战开拓区”(バトルフロンティア)
歌：髙屋亜希那、作词・作曲：Rie、编曲：高梨康治
•OP5对战开拓区篇2-“冲刺！”（スパート！）
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
神奇宝贝超世代(珍珠钻石版)2首：
•OP1神奥联盟篇1-“”
歌：あきよしふみえ、作词：DPプロジェクト、作曲：Rie、编曲：市川淳
•OP2神奥联盟篇2-“”
歌：あきよしふみえ、作词：DPプロジェクト、作曲：Rie、编曲：依田和夫
剧场版13首（长篇7首，短篇6首）：
长篇
•超梦的逆袭-“目标是神奇宝贝大师98”（めざせポケモンマスター'98）
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：渡部チェル
•洛奇亚爆诞-“劲敌”（ライバル）
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず
•结晶塔的帝王-“OK！2000”
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず
•雪拉比穿梭时空的相遇-“目标是神奇宝贝大师2001”（めざせポケモンマスター2001）
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲
•水都的守护神-“目标是神奇宝贝大师2002”（めざせポケモンマスター2002）
歌：coba＆松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：coba
•梦幻与波导的勇者-“对战开拓区”（バトルフロンティア）
歌：高屋亜希那、作词•作曲：Rie、编曲：高梨康治
•决战时空之塔（帝牙卢卡VS帕路奇犽VS达克莱伊）-“”
歌：あきよしふみえ、作词：DPプロジェクト、作曲：Rie、编曲：市川淳
注：七夜的许愿星以“冒险•前进”的节奏替代片头曲，而裂空的访问者片头片尾同一首歌，苍海的王子以“冲刺！”的节奏替代片头曲
短篇
•皮卡丘的欢乐假期-“暑假迷俱乐部”（なつやすみファンクラブ）
歌：ポケモンキッズ ポケモンママさん、作词：戸田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず
•皮卡丘的探险队-“来组一支探险队吧！”（たんけんたいをつくろう！）
歌：ポケモンキッズ、作词：川村久仁美、作曲：たなかひろかず、编曲：中村畅之
•皮丘与皮卡丘-“皮丘皮卡♪荡秋千”（ピチュピカ♪スウィング）
歌：ネオ★ポケッツ、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：たなかひろかず＆ブラックボトムブラスバンド
•皮卡丘的心跳捉迷藏-“捉迷藏（心跳刺激特别版）”（かくれんぼ（ドキドキ･スペシャル･ヴァージョン））
歌：ホワイトベリー、作词：川村恵里加、作曲・编曲：たなかひろかず
•皮卡皮卡的星空露营-“以那座山丘为目标”（あの丘をめざして）
歌：ボケモン５（雨上がり决死队、山田花子、）、作词：ピカピカ・プロジェクト、作曲・编曲：たなかひろかず
•神奇宝贝的跳舞秘密基地-“（跳波尔卡舞）”（ポルカ･オ･ドルカ）
歌：ニャース（犬山犬子）、ノルソル合唱団、作词：戸田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず、振付：パパイヤ铃木、コーラス：江崎とし子
特别篇（OVA）5首（长篇1首，短篇4首）
•雷公雷的传说-“新的誓言”（新たなる誓い）
歌：田村直美、作词：戸田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•皮卡丘的欢乐圣诞99-“寒假迷俱乐部”（ふゆやすみファンクラブ）
歌：ポケモンキッズ ポケモンパパさん（＋ピカチュウ）、作词：戸田昭吾、作曲・编曲・トラックプロ、ラミング：たなかひろかず、マニピュレート：渡部チェル
•皮卡丘的欢乐圣诞2000-“玩游戏的才能（游戏主义宣言）”（アソビズム宣言）
歌：神崎まき、作词：戸田昭吾、作曲•编曲•トラックプログラミング：たなかひろかず、マニピュレート：须藤豪
•皮卡丘的欢乐圣诞2001-“白色之舞”（ホワイトダンス）
歌：爱河里花子、作词：戸田昭吾、作曲・编曲・トラックプログラミング：たなかひろかず、コーラス：岩田光央、マニピュレート：桑岛幻矢
•我们是皮丘兄弟-“皮丘♪皮卡荡秋千”（ピチュピカ♪スウィング）
歌：ネオ★ポケッツ、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：たなかひろかず＆ブラックボトムブラスバンド
香港无线电视翡翠台4首
1.宠物小精灵（1998年，陈浩民）（宠物小精灵）
2.来吧小精灵（2000年，古巨基）（宠物小精灵）
3.奇异冒险（2005年，王祖蓝）（宠物小精灵）
4.超世代之战（2006年，吴卓羲）（横跨宠物小精灵与宠物小精灵超世代）
片尾曲
神奇宝贝(1-276)共13首
•ED1关都(石英)联盟篇-“151”（ひゃくごじゅういち）
歌：大木博士（石冢运升）与作词：户田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•ED2关都(石英)联盟篇-“喵喵之歌”（ニャースのうた）
歌：喵喵（犬山犬子）、作词：户田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•ED3关都(石英)联盟篇-“口袋里的幻想”（ポケットにファンタジー）
歌：さち（小林幸子）＆じゅり（井端珠里）、作词：户田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：中村畅之
•ED4关都(石英)联盟篇-“神奇宝贝歌谣”（ポケモン音头）
歌：ガルーラ小林•ドガース•アーボ（小林幸子•石冢运升•坂口候一）、合音手：新津姊妹、作词：户田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：渡部チェル
•ED5橘子群岛篇-“Type：Wild”（タイプ：ワイルド）
歌：松本梨香、作词：户田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•ED6橘子群岛篇-“坐在乘龙背上”（ラプラスにのって）
歌：小霞（饭冢雅弓）、乘龙（爱河里花子）、作词：川村久仁美、作曲•编曲：たなかひろかず
•ED7城都联盟篇-“喵喵的派对”（ニャースのパーティ）
歌：喵喵（犬山犬子）、作词：户田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•ED8城都联盟篇-“神奇宝贝紧张刺激的接力赛”（ポケモンはらはらリレー）
歌：爱河里花子、作词：户田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず、合唱：はらはらコーラス队
•ED9城都联盟篇-“神奇宝贝紧张刺激2的接力赛（困难版）”（ポケモンはらはら2リレー（むずかしばん)）
歌：：爱河里花子、作词：户田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず、合唱：はらはらコーラス队
•ED10城都联盟篇-“小刚的乐园”（タケシのパラダイス）
歌：小刚（上田祐司＝うえだゆうじ）、作词：户田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•ED11城都联盟篇-“给我最好的朋友”（ぼくのベストフレンドへ）
歌：岩崎宏美、作词：川村久仁美、作曲・编曲：たなかひろかず
•ED12城都联盟篇-“积极乐观的火箭队”（前向きロケット団）
歌：火箭队（武藏、小次郎、喵喵）、作词：户田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず
•ED13城都联盟篇-“有时神奇有时宝贝”（ポケッターリモンスターリ）
歌：可名（かな）、作词：户田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず、振付：茑美代子
神奇宝贝超世代(AG1-191)共7首：
•ED1丰缘（芳缘）联盟篇-“因为那边有天空”（そこに空があるから）
歌：江崎とし子、作词：渡边なつみ、作曲：三留一纯、编曲：恩田直幸
•ED2丰缘（芳缘）联盟篇-“（跳波尔卡舞）”（ポルカ･オ･ドルカ）
歌：喵喵（犬山犬子）＆ノルソル合唱团、作词：户田昭吾、作曲编曲：たなかひろかず、振付：パパイヤ铃木、合唱：江崎とし子
•ED3丰缘（芳缘）联盟篇-“微笑”（第一、二版）（スマイル）
歌：江崎とし子、作词•作曲：江崎とし子、编曲：恩田直幸
•ED4丰缘（芳缘）联盟篇-“尽情的夏天！！”（いっぱいサマー！！）
歌：田村直美与ヒマワリ合唱团、作词：ピカチュウ学芸部、作曲•编曲：たなかひろかず
•ED5丰缘（芳缘）联盟篇-“～灿烂的那一天～”（第一、二、三版）（～辉くその日～）
歌作词ピカチュウ学芸部、作曲•编曲
•ED6对战开拓区篇-“神奇宝贝数数歌”（ポケモンかぞえうた）
歌：金沢明子、作词：戸田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず、ふりつけ：パンプキン北野
•ED7对战开拓区篇-“我、不会输的！～小遥的主题曲～”（私、负けない！～ハルカのテーマ～）
歌作词：吉川兆二、作曲・编曲：西冈和也
神奇宝贝钻石珍珠2首：
•ED1神奥联盟篇-“在你的身边～小光的主题曲～”（初版、.版、.版）（君のそばで～ヒカリのテーマ～）
歌：グリン、作词・作曲＆编曲：依田和夫
•ED2神奥联盟篇-“风的信息”（初版、.版）（风のメッセージ）
歌：水桥舞、作词：Sky-Boys、作曲：纱希、编曲：西冈和哉
剧场版16首（长篇有10首，短篇6首）
长篇
•超梦的逆袭（日）-“与风一起”（风といっしょに）
歌：小林幸子、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：沢田完、コーラス音羽ゆりかご会
•超梦的逆袭（台）-“目标是神奇宝贝大师98”（めざせポケモンマスター'98）
歌：松本梨香、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：渡部チェル
•洛奇亚爆诞-“（你的和我的）”
歌：安室奈美恵、作词：MARC小室哲哉（TK）、作曲・编曲：小室哲哉（TK）
•结晶塔的帝王-“彩虹诞生的日子”（虹がうまれた日）
歌：森公美子、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：鸟山雄司
•雪拉比穿梭时空的相遇-“希望明天是个好天气”（明日天気にしておくれ）
作词：藤井フミヤ、作曲：たなかひろかず、编曲：冨田素弘、歌：藤井フミヤ
•水都的守护神-“不是孤孤单单一个人”（ひとりぼっちじゃない）
歌：coba＆宫沢和史、作词：宫沢和史、作曲•编曲：coba
•七夜的许愿星-“小小的我”（小さきもの）
歌：林明日香、作词：三浦徳子、作曲・编曲：山移高寛
•裂空的访问者-“L･O･V･E･L･Y～梦中的～”（L･O･V･E･L･Y～梦见る～）
歌作词作曲・编曲-
•梦幻与波导的勇者-“开始之歌”（はじまりのうた）
歌・作词作曲编曲
•宠物小精灵保育家与苍海的王子-“该守护的东西”（守るべきもの）
歌作词作曲
•决战时空之塔(帝牙卢卡VS帕路奇犽VS达克莱伊)-“”
歌
•骑拉帝纳与冰空的花束(暂)-“ONE”
歌
短篇
•皮卡丘的欢乐假期-“闪闪发亮的过暑假”（ピカピカまっさいチュウ）
歌：ポケモンキッズ＆オーキド博士（石冢运升）＋ピカチュウ（大谷育江）、作词：戸田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず
•皮卡丘的探险队-“飞翔的神奇宝贝小孩”（そらとぶポケモンキッズ）
歌：ベッキー、作词：戸田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•皮丘与皮卡丘-“朋友纪念日”（ともだち记念日）
歌：酒井法子＆竹中直人、コーラス：ネオ★ポケッツ、作词：戸田昭吾、作曲：たなかひろかず、编曲：岛健
•皮卡丘的心跳捉迷藏-“盛夏大作战！”（まなつのだいさくせん！）
作词：戸田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず、歌：远藤久美子
•皮卡皮卡的星空露营-“有时神奇有时宝贝”（ポケッターリ モンスターリ）
歌：可名（かな）、作词：戸田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず、振付：茑美代子
•神奇宝贝的跳舞秘密基地-“冒险开始了！！”（冒険のはじまりだ！！）
歌作词：吉川兆二、作曲•编曲：たなかひろかず
周刊放送局1首＆星期天4首：
•周刊神奇宝贝播放局-“行进进行曲”（マーチングマーチ）
歌作词：RYO-Z、作曲•编曲
•神奇宝贝星期天-
•ED1“！！”（ハロー！サンキュー！）
歌：ベッキー、作词：渡辺なつみ、作曲・编曲：たなかひろかず
•ED2“YEAH！”
歌チーム、作词-p、作曲编曲：S. C. E.
•ED3“喵喵的大日子”（ビッグ･ニャース･ディ）
作词：ピカチュウ学芸部、作曲＆编曲：三留一纯、歌：ニャース（犬山イヌコ）＆ノリノリガールズ
•ED4“神奇宝贝扮装星期天”（ポケモンなりきりサンデー）
歌：中川翔子、作词：戸田昭吾•中川翔子、作曲：たなかひろかず
特别篇（OVA）6首（长篇2首，短篇4首）：
•超梦重现风云再起！-“给我最好的朋友”（ぼくのベストフレンドへ）
歌：岩崎宏美、作词：川村久仁美、作曲•编曲：たなかひろかず
•雷公雷的传说-“新的誓言”（新たなる誓い）
歌：田村直美、作词：戸田昭吾、作曲•编曲：たなかひろかず
•皮卡丘的欢乐圣诞99-“色彩缤纷的寒假”（カラフルふゆやすみ）
歌：ポケモンキッズ＆オーキド博士（＋ピカチュウ／ママ）、作词：戸田昭吾、作曲•编曲•トラックプログラミング：たなかひろかず、マニピュレート：渡部チェル
•皮卡丘的欢乐圣诞2000-“圣诞前夜”（クリスマスイヴ）
歌：神崎まき、作词：戸田昭吾、作曲・编曲・トラックプログラミング：たなかひろかず、コーラス：ポケモンキッズ＆音羽ゆりかご会、マニピュレート：须藤豪、ハモンドオルガン＆フェンダーローズピアノ：中西康晴
•皮卡丘的欢乐圣诞2001-“圣诞老人快要来了！”（もうすぐサンタがやってくる！）
歌：すどうまゆみ、作词：须藤真由美、作曲•编曲•トラックプログラミング：たなかひろかず、マニピュレート：桑岛幻矢
•我们是皮丘兄弟-“我们是皮丘兄弟！”（ぼくらピチュピチュブラザーズ！）
歌：远藤久美子、作词：戸田昭吾、作曲・编曲：たなかひろかず、声：ピチュー兄弟（こおろぎさとみ＆冬马由美）
社会反响流行文化神奇宝贝作为一个高人气的系列作品，口袋妖怪系列在流行文化中无疑留下了自己的记号。口袋妖怪系列中登场的口袋妖怪们也变成了流行文化的符号：梅西感恩节大游行上两个不一样的皮卡丘气球、全日空的口袋妖怪喷气机、数以千计的衍生商品，名古屋和台北的口袋妖怪公园等等。神奇宝贝在1999年登上了时代杂志。
2011年11月人，任天堂在纽约洛克菲勒中心建立了神奇宝贝中心商店。其设计模仿了大阪和东京的其他两个神奇宝贝中心，并以口袋妖怪系列游戏中的标志物命名——神奇宝贝中心是训练师用来给神奇宝贝们在对战后恢复体力的功能性建筑。商店在两层内出售从神奇宝贝T恤到填充玩具在内的一系列神奇宝贝周边产品。
作品评价约瑟夫;托宾将系列的成功归功于一串能被观众被记忆并交流的神奇宝贝名称。内涵丰富的神奇宝贝世界观提供给了观众们讨论、猜想并证明的平台。在各种语言的神奇宝贝系列中，任天堂特别注意了神奇宝贝名称的译，使其体现各个地区的文化特征。命名是以神奇宝贝的特质为原则进行的，这符合了孩子们认为名字具有特别象征的观念。孩子们可以在结组讨论中通过评价神奇宝贝们形象来证实自己的个性与同他人之间的共性。
关联作品《口袋妖怪》（ポケットモンスター）是由Game 和株式会社开发，由任天堂发行的一系列游戏，是神奇宝贝系列媒体作品的一部分。最初的作品是在1996年于日本发行的Game Boy角色扮演游戏。口袋妖怪系列一直贯穿任天堂的各代掌机之中。系列中的游戏通常成对发售（有所区别），复刻版常出现在初版游戏发布的几年后。游戏的主系列由角色扮演类游戏组成，旁支系列的游戏则包含有其他的类型，例如动作角色扮演游戏、益智游戏和电子宠物等。口袋妖怪系列是世界上第二热销的系列电子游戏，仅次于任天堂的马里奥系列。
